微孔曝气管堵管后，清理时把微孔曝气管外表洗刷干净，再用家用洗涤剂清洗晒干；微孔增氧曝气管也可用化学药物溶液浸泡。溶液的配方是硫酸铜 3 -4 千克 ，甲酸10 -15 升 ，加淡水 400 升 ，浸泡微 孔增氧曝气管2-3 天后，用水冲洗干净，晒干。经过硫酸铜处理的微孔增氧曝气管，杀灭了休眠的孢子，一般可减少 50% 的附生藻类生物。但残留的硫酸根离子造成的后果使下次清理更麻烦。然后放置在太阳下爆晒 2 天，使微孔内的藻类菌丝干透后收缩，接吹气管带压力然后悬空拍打，使其部分随气流脱落。由于微孔是曲折通道，一般能恢复 60% 的效果，二次洗刷清理只能恢复一半的新管出气效果。不宜选用强酸或强碱溶液，以免加速微孔增氧曝气管的老化。
曝气管堵管时正好出现在养殖高峰期间，基本上没机会连续几天拿出塘清洗爆晒。所以实践证明条式安装根本不能正常一年养到头，微孔曝气盘也要准备2套，以备急用。
要解决实际问题，只有选用兴德牌抗菌型微孔曝气增氧管，属于独一无二的更新换代产品，在原有的微孔增氧曝气管配方中添加非常昂贵的不亲水钠米抑菌剂，络合在塑料基团内的抗菌元素，不会扩散到水体中，更不会污染底质。只是被动地杀灭附着在上面的细菌，属接触反应抗菌机理。
